H κλήρωση του EuroCup θα πραγματοποιηθεί στις 7 Ιουλίου και η ΑΕΚ τοποθετήθηκε στο 5ο γκρουπ δυναμικότητας. Η Euroleague ανακοίνωσε τα έξι γκρουπ δυναμικότητας που δημιουργήθηκαν, κι από τα οποία θα προκύψουν εν συνεχεία οι ομάδες των τεσσάρων ομίλων που θα συγκροτηθούν
Οσον αφορά στο σύστημα διεξαγωγής οι 24 ομάδες θα χωριστούν σε τέσσερις ομίλους των έξι ομάδων. Την πρόκριση για τη φάση των «16» εξασφαλίζουν οι οι τέσσερις καλύτερες ομάδες από κάθε όμιλο, δημιουργώντας νέους ομίλους (τέσσερις των τεσσάρων). Διπλοί νοκ άουτ αγώνες προβλέπονται στην προημιτελική φάση, την ημιτελική και στους τελικούς. Ο κάτοχος του τίτλου του EuroCup εξασφαλίζει τη συμμετοχή στη Euroleague της επόμενης σεζόν (2017-18).
Εν όψει της κλήρωσης της 7ης Ιουλίου, η Euroleague ενημέρωσε πως ομάδες από την ίδια χώρα δεν θα μπορούν να μπουν στον ίδιο όμιλο -με εξαίρεση τις περιπτώσεις που οι ομάδες που συμμετέχουν είναι περισσότερες από τους ομίλους (βλ. Ισπανία, που έχει πέντε ομάδες).
Στο 1ο γκρουπ βρίσκονται τρεις ρωσικές ομάδες, ανάμεσα στις οποίες η Λοκομοτίβ Κουμπάν του Γιώργου Μπαρτζώκα, ενώ η ΑΕΚ βρίσκεται στο 5ο γκρουπ.
Τα γκρουπ δυναμικότητας στο EuroCup ενόψει της κλήρωσης (7/7) για τη σεζόν 2016-17 έχουν ως εξής:
1ο ΓΚΡΟΥΠ: Λοκομοτίβ Κουμπάν (Ρωσία), Κίμκι (Ρωσία), Νίζνι Νόβγκοροντ (Ρωσία), Ουνικάχα Μάλαγα (Ισπανία)
2ο ΓΚΡΟΥΠ: Βαλένθια (Ισπανία), Άλμπα Βερολίνου (Γερμανία), Μπάγερν Μονάχου (Γερμανία), Γκραν Κανάρια (Ισπανία)
3ο ΓΚΡΟΥΠ: Τσεντεβίτα Ζάγκρεμπ (Κροατία), Μπιλμπάο (Ισπανία), Μούρθια (Ισπανία), Ολίμπια Λιουμπλιάνας (Σλοβενία)
4ο ΓΚΡΟΥΠ: Χαπόελ Ιερουσαλήμ (Ισραήλ), Λιέτουβος Ρίτας (Λιθουανία), Σάσαρι (Ιταλία), Ζιελόνα Γκόρα (Πολωνία)
5ο ΓΚΡΟΥΠ: Ζενίτ Αγ. Πετρούπολης (Ρωσία), Καντού (Ιταλία), ΑΕΚ, Ουλμ (Γερμανία).
6ο ΓΚΡΟΥΠ: Μπούντουτσνοστ (Μαυροβούνιο), Παρτίζαν (Σερβία), Τρέντο (Ιταλία), Ρέτζιο Εμίλια (Ιταλία)